Changes between Version 6 and Version 7 of DespoinaLog/2010/12/08


Ignore:
Timestamp:
2010-12-08T13:50:50+01:00 (15 years ago)
Author:
antonak
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • DespoinaLog/2010/12/08

    v6 v7  
    33 * org.molgenis.framework.db.!DatabaseException: Unknown column '!OntologyTerm.!__Type' in 'where clause'
    44   * Was this produced after the import ? (generate gcc, update db -> test if it is shown --> import -> test if it's there)
    5    * So this is the problem: 
    6    *    * mysql> describe !OntologyTerm;
     5   * So this is the problem for !OntologyTerm :
     6   * * mysql> describe !OntologyTerm;
    77   * +---------------+--------------------------------+------+-----+---------+----------------+
    8    * | Field         | Type                           | Null | Key | Default | Extra          |
     8   * | Field         | Type                           | Null | Key | Default | Extra          |
    99   * +---------------+--------------------------------+------+-----+---------+----------------+
    10    * | id            | int(11)                        | NO   | PRI | NULL    | auto_increment |
    11    * | name          | varchar(127)                   | NO   |     | NULL    |                |
    12    * | !__Type        | enum('!OntologyTerm','Species') | NO   |     | NULL    |                |
    13    * | ontology      | int(11)                        | YES  | MUL | NULL    |                |
    14    * | termAccession | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |                |
    15    * | definition    | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |                |
    16    * | termPath      | varchar(1024)                  | YES  |     | NULL    |                |
     10   * | id            | int(11)                        | NO   | PRI | NULL    | auto_increment |
     11   * | name          | varchar(127)                   | NO   |     | NULL    |                |
     12   * | !__Type        | enum('!OntologyTerm','Species') | NO   |     | NULL    |                |
     13   * | ontology      | int(11)                        | YES  | MUL | NULL    |                |
     14   * | termAccession | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |                |
     15   * | definition    | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |                |
     16   * | termPath      | varchar(1024)                  | YES  |     | NULL    |                |
    1717   * +---------------+--------------------------------+------+-----+---------+----------------+
    1818   * 7 rows in set (0.04 sec)
    … …  
    2020   * mysql> describe bbmri_old.!OntologyTerm;
    2121   * +---------------+--------------+------+-----+---------+----------------+
    22    * | Field         | Type         | Null | Key | Default | Extra          |
     22   * | Field         | Type         | Null | Key | Default | Extra          |
    2323   * +---------------+--------------+------+-----+---------+----------------+
    24    * | id            | int(11)      | NO   | PRI | NULL    | auto_increment |
    25    * | term          | varchar(255) | NO   |     | NULL    |                |
    26    * | ontology      | int(11)      | YES  | MUL | NULL    |                |
    27    * | termAccession | varchar(255) | YES  |     | NULL    |                |
    28    * | definition    | varchar(255) | YES  |     | NULL    |                |
     24   * | id            | int(11)      | NO   | PRI | NULL    | auto_increment |
     25   * | term          | varchar(255) | NO   |     | NULL    |                |
     26   * | ontology      | int(11)      | YES  | MUL | NULL    |                |
     27   * | termAccession | varchar(255) | YES  |     | NULL    |                |
     28   * | definition    | varchar(255) | YES  |     | NULL    |                |
    2929   * +---------------+--------------+------+-----+---------+----------------+
    30    * 5 rows in set (0.01 sec)
    31    *
     30   * 5 rows in set (0.01 sec) 
     31 *  * mysql> describe biobanks;
     32 * ERROR 1146 (42S02): Table 'bbmri.biobanks' doesn't exist
     33 * mysql> describe biobank;
     34 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     35 * | Field       | Type                           | Null | Key | Default | Extra |
     36 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     37 * | Acronym     | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |       |
     38 * | Category    | int(11)                        | NO   | MUL | NULL    |       |
     39 * | Type        | enum('core','support','other') | NO   |     | NULL    |       |
     40 * | Size        | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |       |
     41 * | !LastUpdate  | date                           | NO   |     | NULL    |       |
     42 * | Description | text                           | YES  |     | NULL    |       |
     43 * | id          | int(11)                        | NO   | PRI | NULL    |       |
     44 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     45 * 7 rows in set (0.00 sec)
     46 *
     47 * mysql> describe bbmri_old.biobank;
     48 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     49 * | Field       | Type                           | Null | Key | Default | Extra |
     50 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     51 * | Acronym     | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |       |
     52 * | Category    | int(11)                        | NO   | MUL | NULL    |       |
     53 * | Type        | enum('core','support','other') | NO   |     | NULL    |       |
     54 * | Size        | varchar(255)                   | YES  |     | NULL    |       |
     55 * | !LastUpdate  | date                           | NO   |     | NULL    |       |
     56 * | Description | text                           | YES  |     | NULL    |       |
     57 * | id          | int(11)                        | NO   | PRI | NULL    |       |
     58 * +-------------+--------------------------------+------+-----+---------+-------+
     59 * 7 rows in set (0.00 sec)
     60 *