Changes between Version 16 and Version 17 of MolgenisComponents


Ignore:
Timestamp:
2010-11-26T09:12:15+01:00 (14 years ago)
Author:
Morris Swertz
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • MolgenisComponents

    v16 v17  
    33Here you can find summaries and links on the components listed in the ticket system. In the software, these components become packages. For example: org.molgenis.db for shared pacakes or org.col7a1 for application specific packages. We distinguish two groups of components as listed below. Also the use of '''keywords''' is explained which we use to clarify relationships from shared packages to application. For example: tickets in the 'auth' component can be marked with keywords 'animaldb' to enable tracking by the animaldb team.
    44
     5{{{#!graphviz
     6
     7digraph g {
     8        node [shape=box,style=filled,color=white]
     9        rankdir="LR"
     10   
     11subgraph cluster_0 {
     12                style=filled;
     13                color=lightgrey;
     14                label = "partner & user groups";
     15
     16                lifelines;
     17                bbmri;
     18                nbic;
     19                panacea;
     20                sysgenet;
     21                euratrans;
     22                gen2phen;
     23                gbic;
     24                medgen;
     25                fwn_chronobiology;
     26                npc_mass_spec_center;
     27                gids;
     28                col7a1;
     29                chd7;
     30                amc_nbic;
     31                         
     32}
     33
     34subgraph cluster_1 {
     35                style=filled;
     36                color=lightgrey;
     37                label = "apps";
     38                biobankatlas
     39                animaldb
     40                mutationdb
     41                workbench
     42                xqtl_workbench
     43                ngs_workbench
     44                gwas_workbench
     45                ms_workbench
     46                ma_workbench
     47                jamboreecards
     48}
     49
     50subgraph cluster_2 {
     51                style=filled;
     52                color=lightgrey;
     53                label = "molgenis";
     54                phenoexplorer;
     55                db;
     56                ui;
     57                auth;
     58                molgenis;
     59                lims;
     60                compute;
     61                convertors;
     62                datamodels;
     63                xgap;
     64                pheno;
     65}
     66
     67#relations between projects and apps
     68col7a1 -> mutationdb;
     69chd7 -> mutationdb;
     70
     71fwn_chronobiology -> animaldb;
     72
     73bbmri -> biobankatlas;
     74nbic -> biobankatlas;
     75lifelines -> biobankatlas;
     76gen2phen -> biobankatlas;
     77gids -> biobankatlas;
     78
     79gbic -> xqtl_workbench;
     80panacea -> xqtl_workbench;
     81sysgenet -> xqtl_workbench;
     82euratrans -> xqtl_workbench;
     83
     84npc_mass_spec_center -> ms_workbench;
     85
     86bbmri -> ngs_workbench;
     87seq_facility -> ngs_workbench;
     88medgen -> ngs_workbench;
     89
     90bbmri -> ma_workbench;
     91
     92bbmri -> gwas_workbench
     93lifelines -> gwas_workbench;
     94gids -> gwas_workbench;
     95medgen -> gwas_workbench;
     96
     97amc_nbic -> jamboreecards;
     98
     99#relations between apps and components
     100ngs_workbench ->workbench;
     101gwas_workbench -> workbench;
     102xqtl_workbench -> workbench;
     103ms_workbench -> workbench;
     104ma_workbench -> workbench;
     105
     106biobankatlas -> phenoexplorer;
     107animaldb -> phenoexplorer;
     108mutationdb -> phenoexplorer;
     109workbench -> phenoexplorer;
     110
     111animaldb -> lims;
     112workbench -> lims;
     113
     114workbench -> convertors;
     115
     116jamboreecards -> molgenis;
     117
     118#relations between components and sub-components
     119molgenis -> auth;
     120molgenis -> db;
     121molgenis -> ui;
     122
     123lims -> datamodels;
     124compute -> datamodels;
     125phenoexplorer -> datamodels;
     126convertors -> datamodels;
     127
     128workbench -> compute;
     129
     130datamodels -> molgenis;
     131datamodels -> pheno;
     132datamodels -> xgap;
     133
     134}
     135
     136
     137}}}
     138
     139
    5140
    6141       
    7 TODO
    8142
    9         animaldb
    10         auth    rwagner         
    11         biobankexplorer
    12         col7a1
    13         compute                 
    14         convertors     
    15         curation               
    16         datamodels             
    17         db                     
    18         documentation                   
    19         gids           
    20         gwas-workbench 
    21         impute         
    22         jamboreecards
    23         lifelines
    24         lims
    25         molgenis
    26         newsfeed       
    27         ngspipeline
    28         pheno
    29         ui                     
    30         xgap    jvelde
    31         xqtl
    32143
    33144