| Version 3 (modified by , 13 years ago) (diff) |
|---|
As a user, I want to select a phenotype and a list of individuals in the Molgenis Research Portal and then run a GWAS on the LL geno data
Scrum: ticket:1052
Acceptance criteria: Als de gebruiker het phenotype heeft geselecteerd gaat programma dus, gegeven lijst van individuen, de gehele bed (?) file doorlopen en (1) rijen weglaten van individuals die niet in de view zitten en (2) de pheno kolom aanpassen met het juiste phenotype. Implementatie is afhankelijk van hoe lang dit proces duurt. Is het 'klaar terwijl je wacht' dan kan het gewoon als plugin. Anders moet het via MOLGENIS compute zoals Joeri beschrijft. Output: /gpfs/target/lifelines/study1/results/myselection1.bed Status per sub-story:
